Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Treml4Q3LRV9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms