Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms