Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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