Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
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Rpusd3Q14AI6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Rpusd3Q14AI6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Rpusd3Q14AI6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpusd3Q14AI6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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