Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab42Q0PD08 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms