Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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