Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ssrp1Q08943 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssrp1Q08943 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms