Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cnn1Q08091 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cnn1Q08091 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms