Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox9Q04887 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms