Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox8Q04886 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox8Q04886 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms