Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col6a1Q04857 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms