Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cxcr5Q04683 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms