Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GscQ02591 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GscQ02591 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GscQ02591 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GscQ02591 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GscQ02591 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GscQ02591 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GscQ02591 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GscQ02591 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GscQ02591 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GscQ02591 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms