Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snai1Q02085 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai1Q02085 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms