Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms