Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb2Q00977 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb2Q00977 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms