Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apoa1Q00623 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms