Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bop1P97452 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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