Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcgP82348 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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