Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otx1P80205 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Otx1P80205 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms