Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ldb1P70662 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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