Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53bp1P70399 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms