Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp9xP70398 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms