Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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