Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tdrd6P61407 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tdrd6P61407 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tdrd6P61407 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tdrd6P61407 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tdrd6P61407 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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