Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms