Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpa1P57784 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpa1P57784 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms