Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp25P57080 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp25P57080 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp25P57080 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp25P57080 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp25P57080 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp25P57080 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp25P57080 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp25P57080 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp25P57080 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp25P57080 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp25P57080 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp25P57080 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp25P57080 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp25P57080 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp25P57080 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp25P57080 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Usp25P57080 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms