Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bace1P56818 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bace1P56818 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms