Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmoP56726 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmoP56726 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmoP56726 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmoP56726 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmoP56726 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmoP56726 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmoP56726 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmoP56726 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmoP56726 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SmoP56726 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms