Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtswP56203 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtswP56203 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtswP56203 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtswP56203 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtswP56203 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtswP56203 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtswP56203 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtswP56203 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtswP56203 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtswP56203 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtswP56203 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtswP56203 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtswP56203 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtswP56203 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtswP56203 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtswP56203 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtswP56203 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtswP56203 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtswP56203 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtswP56203 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms