Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ephb3P54754 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ephb3P54754 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms