Protein–RNA interactions for Protein: P54227

Stmn1, Stathmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmn1P54227 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmn1P54227 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmn1P54227 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmn1P54227 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmn1P54227 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmn1P54227 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmn1P54227 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmn1P54227 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stmn1P54227 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms