Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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Tmod1P49813 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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Tmod1P49813 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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Tmod1P49813 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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Tmod1P49813 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmod1P49813 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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