Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnni3P48787 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnni3P48787 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms