Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab11bP46638 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rab11bP46638 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rab11bP46638 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rab11bP46638 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rab11bP46638 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rab11bP46638 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rab11bP46638 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rab11bP46638 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rab11bP46638 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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