Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syt1P46096 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms