Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ItgavP43406 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms