Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LtbP41155 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LtbP41155 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LtbP41155 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LtbP41155 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LtbP41155 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LtbP41155 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LtbP41155 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LtbP41155 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LtbP41155 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LtbP41155 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms