Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms