Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lig1P37913 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lig1P37913 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms