Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc10P31257 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms