Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PrkcdP28867 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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