Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mmp3P28862 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp3P28862 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms