Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RxraP28700 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxraP28700 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxraP28700 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxraP28700 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxraP28700 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxraP28700 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxraP28700 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxraP28700 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxraP28700 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RxraP28700 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RxraP28700 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RxraP28700 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RxraP28700 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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