Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Marcksl1P28667 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms