Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa2P28309 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa2P28309 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms