Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl3P27659 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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