Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd8P23463 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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