Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klra1P20937 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms